Vous aurez pour rôle principal de développer un outil pour l’intégration des données d’imagerie et des données de dosimétrie pour étudier la corrélation, extraire des biomarqueurs et définir de nouvelles cibles pour la radiothérapie.
Vos principales tâches :
• Participer, avec la chercheuse, au post traitement des images de l’IRM morphologique, de l’IRM de perfusion, de diffusion et de la spectroscopie.
• La maintenance de la base de données
• Implémenter l’analyse de la spectroscopie
• Participer à la spécification de l’outil logiciel
• Intégrer toutes les modalités d’imagerie dans le même outil logiciel
• Implanter et optimiser les algorithmes en langage C++.
• Tester et valider l’outil
• Interagir avec les membres de l’équipe
Diplôme d’une école d’ingénieur en génie informatique, traitement d’images, génie logiciel, ou Diplôme universitaire (Master ou Thèse)
Programmation en C++, MATLAB, Python. Géométrie 3D et calcul matriciel. Traitement d’images médicales. Traitement d’images avec la bibliothèque ITK. Autres compétences : méthodique, rigoureux (se), organisé(e) ; bonne capacité de travail, travail en équipe
Un poste d’ingénieur(e) de recherche en traitement d’image et développement informatique est à pourvoir pour une durée de 3 ans à temps plein, dans le cadre du lancement du projet de recherche en radiomique, nommé « Gliomique ».
Le glioblastome multiforme est la tumeur cérébrale primitive la plus agressive et la plus fréquente chez l’adulte, dont le traitement comporte systématiquement de la radiothérapie (RT). Afin de surmonter la résistance fréquente à la RT, est actuellement mené un essai multicentrique, SPECTRO GLIO, sur 220 patients augmentant la dose de RT guidée par l’imagerie de spectrométrie de résonance magnétique. Cet essai a pour but d’augmenter la survie des patients, la majorité des inclusions ont été faites. Une large banque de données d’imagerie et de radiothérapie est disponible, qui devrait apporter de très nombreuses informations sur le comportement tumoral en imagerie métabolique et fonctionnelle. C’est pourquoi un outil informatique innovant de radiomique, Gliomique, va être développé, pour analyser et comparer ces données afin de définir de nouvelles cibles issues de nombreux types d’imagerie différents. Le but est d’avoir rapidement les résultats de cet essai clinique pour pouvoir ensuite remettre en oeuvre un prochain essai clinique, toujours dans le but d’augmenter la survie des patients.
Le/la candidat(e) travaillera dans une environnement riche avec plusieurs membres de l’unité INSERM dont la chercheuse dédiée au projet (F Tensaouti) , la coordinatrice du projet (Pr A Laprie, Oncologue Radiothérapeute), un ingénieur d’application, un chercheur spécialisé en IRM, un développeur de logiciel et une neuroradiologue. Des collaborations industrielles sont prévues.
