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Ingénieur(e) de recherche – Deep Learning pour l’imagerie médicale et jumeau numérique de l’aorte thoracique

Published on::24 April 2026
Application dates ::Du -- au 20 May 2026
Location::Aix-Marseille Université / Marseille, France – Campus de médecine de la Timone
Job type ::Fixed-term contract
Type of position ::Ingénieur de Recherche
Language ::Français

Background and mission :

Nous recrutons un(e) ingénieur(e) de recherche dans le cadre d’un projet financé par l’ANR consacré au développement d’un jumeau numérique du système cardiovasculaire, avec un focus particulier sur la modélisation du flux sanguin dans l’aorte thoracique.

Le projet combine imagerie médicale, intelligence artificielle et modélisation biomédicale afin de développer des outils avancés pour l’analyse et la compréhension des pathologies cardiovasculaires.

La personne recrutée travaillera dans un environnement interdisciplinaire à l’interface entre mathématiques appliquées, apprentissage automatique et médecine cardiovasculaire.

 

Missions

Les missions principales incluent :

  • la préparation, l’organisation et la gestion de bases de données d’imagerie médicale, principalement IRM et scanners (CT) ;
  • le développement et l’entraînement de modèles d’apprentissage profond pour la segmentation automatique de l’aorte thoracique ;
  • l’évaluation et la validation des méthodes développées dans le cadre du projet ;
  • la collaboration avec une équipe interdisciplinaire de chercheurs, cliniciens et ingénieurs.

 

Pourquoi rejoindre ce projet ?

Ce poste offre l’opportunité de :

  • travailler sur un projet de recherche innovant à l’interface entre IA et médecine cardiovasculaire ;
  • développer des méthodes avancées d’apprentissage profond appliquées à l’imagerie médicale ;
  • collaborer avec une équipe interdisciplinaire réunissant chercheurs, ingénieurs et cliniciens ;
  • contribuer à la construction d’un jumeau numérique du système cardiovasculaire, un domaine en pleine expansion dans la recherche biomédicale ;
  • évoluer dans un environnement scientifique international dynamique.

 

Durée du contrat : 18 mois

Skills required:

Les candidat(e)s doivent :

  • être titulaires d’un Master (MSc) avec au moins 3 ans d’expérience solide ou d’un doctorat (PhD) ;
  • posséder une expérience pratique en réseaux de neurones, notamment pour des tâches de segmentation ou de détection ;
  • avoir une bonne connaissance des données issues de l’imagerie médicale ;
  • maîtriser la programmation scientifique (Python, PyTorch ou TensorFlow).

Un exercice pratique pourrait être propose selon l’expérience des candidats.

Compensation :

Environ 2100 € net mensuel, selon l’expérience

Structure :

Le poste est basé à Marseille, sur le campus de médecine de la Timone, dans un environnement scientifique réunissant mathématiciens, informaticiens et cliniciens.

Marseille est une ville méditerranéenne dynamique offrant un cadre de vie attractif, un écosystème scientifique riche et une excellente accessibilité internationale.

Contact::

Monique Bernard (monique.bernard@univ-amu.fr), Badih Ghattas (badih.ghattas@univ-amu.fr), Frank Kober (frank.kober@univ-amu.fr)

Le dossier de candidature doit être envoyé sous forme d’un dossier compressé zip nommé Nom_Prenom.zip et contenant au moins les fichiers suivants

  • CV avec références.
  • Lettre de motivation insistant sur l’adéquation du candidat avec le profil du poste.
  • Si vous avez une thèse, Intitulé de la thèse, laboratoire, directeurs, date d’obtention et résumé.
  • Liste de publications s’il y en a, avec lien d’accès.

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