Posted on : Tuesday 14 June 2022

Job title : CDD Ingénieur de recherche en neuroimagerie

Organization : Chef de projet production (analyse d’image et base de données) dans le cadre de projets multicentriques en neuroimagerie.

Mission : La plateforme CATI (Centre pour l’Acquisition et le Traitement des Images), dédiée à l’harmonisation et à l’analyse des données de neuroimagerie dans le cadre de projets multicentriques de recherche clinique, a été créée début 2011 dans le cadre du plan Alzheimer. Le démarrage de cette plateforme s’est appuyé sur une grande variété d’expertises provenant de plusieurs équipes de recherche, à Neurospin (CEA, INRIA), à l’Institut du Cerveau (ICM - CNRS, SU, ICM, INRIA) et au Laboratoire d’Imagerie Biomédicale (LIB - SU, Inserm, CNRS). Elle s’appuie aujourd’hui sur un réseau national d’une soixantaine de services d’imagerie (IRM, TEP et TEMP) auquel s’ajoutent une dizaine de centres à l’étranger. Une trentaine de projets de recherche font aujourd’hui appel à ses services, qui s’étendent du design et l’implémentation de protocoles d’acquisition jusqu’à la mise à disposition des données acquises et des résultats d’analyses sur un serveur web sécurisé. Les acquisitions réalisées dans le cadre des projets de recherche sont collectées grâce à une solution sécurisée pour être analysées de manière centralisée à l’ICM, Neurospin et au LIB. Ces analyses sont effectuées avec un niveau de qualité élevé grâce à une organisation systématisée de leur production à partir de logiciels de référence, dont certains ont initialement été conçus au sein des équipes de recherche à l’origine du CATI.

Un poste de chef de projet en CDD est à pourvoir à Paris à l’ICM au sein de l’équipe CATI. Le/la candidat/e sera chargé/e des missions suivantes :

Activités en gestion de projet “production” :
● Coordonner la planification des traitements d’image selon les contraintes des études.
● Coordonner l’intégration des données collectées et des résultats des analyses dans le flux interne CATI en assurant leur cohérence.
● Coordonner la réalisation des missions du CATI pour certaines études (suivi des traitements, communication, cohérence des données, mise à disposition…).
● Participer à la rédaction et/ou maintenance des procédures liées à la production (analyses et leur contrôle qualité, flux interne et mise à disposition).
● Participer à l’identification de nouveaux besoins selon les demandes utilisateurs et aux discussions avec les utilisateurs lors de la définition des besoins.

Activités en production :
● Participer au contrôle qualité des données de neuroimagerie (IRM et/ou TEP/TEMP) collectées dans la plateforme logicielle dédiée.
● Prendre en charge la réalisation des traitements et leur contrôle qualité dans l’environnement logiciel unifié.

Activités en R&D :
● Assurer le fonctionnement et la validité des chaînes de traitements et participer à leur amélioration éventuelle ; coordonner le passage en production de ces améliorations.
● Participer au développement de nouvelles approches de contrôle qualité (données ou résultats) dans l’environnement CATI et à leur validation.
● Participer à la veille bibliographique sur les méthodes d’analyses implémentées ou à ajouter à l’offre CATI, et éventuellement participer à leur implémentation dans l’environnement unifié du CATI.
● Mener des missions d’analyse et de suivi global de la qualité des données et des résultats de certaines chaînes de traitements.

Aspects pratiques
● Des déplacements réguliers à Neurospin (91) sont à envisager.
● Un jour de télétravail hebdomadaire peut être envisagé.
● CDD de 12 mois, renouvelable, salaire selon expérience.

Locality : Institut du Cerveau ICM, hôpital Pitié Salpêtrière, Paris (13)

Remuneration :

Degrees required : ● Titulaire d’un diplôme de niveau bac +5 ou plus en bio informatique, imagerie médicale ou neurosciences. ● Une première expérience dans le domaine est souhaitable.

Skills required : ● Connaissances et expérience en traitement de données en (neuro)imagerie. ● Une connaissance en programmation informatique serait un plus (langage Python). ● Expérience dans le traitement de données (dans un environnement Linux, si possible). ● Maîtrise de techniques / d’outils de gestion de projet. ● Maîtrise des outils de bureautique. ● Maîtrise de l’anglais technique à l’écrit et à l’oral.

Contact : Marie CHUPIN : marie.chupin@upmc.fr / Emmanuelle GOURIEUX : emmanuelle.gourieux@icm-institute.org