Ingénieur de recherche du programme ANDIMBA – CDD 18 Mois
Contexte et mission :
BAP : BAP A : « Science de la vie, de la Terre et de l’environnement » / FAP « Biologie et santé, Sciences de la vie et de la terre »
Missions :
Adaptation et mise en œuvre d’outil de neuroanatomie informatisée, traitement et analyse de données IRM anatomiques, dans le cadre du programme ANDIMBA (ANR-19-CE17-0028-01, Spectre de l’Alcoolisation Fœtale : identification de marqueurs neuro-anatomiques en IRM), en collaboration avec l’investigateur principal et les investigateurs associés. La mission comprend la participation aux trois tâches suivantes du programme :
• adaptation d’outils de traitement d’images adaptés aux objectifs et données du programme
• traitement des images IRM pour obtention des paramètres neuroanatomiques d’intérêt
• identification de marqueurs par analyse normative et modélisation prédictive multivarié
Activités principales :
• Traitement des images IRM (patients, contrôles) pour estimation de paramètres d’intérêt :
– application d’un nouvel outil de mesure non supervisée du corps calleux (étude princeps)
– adaptation et application de 2 outils de segmentation des hémisphères cérébraux
• Analyse comparative (patients, contrôles) et intégrative des paramètres neuroanatomiques :
– modélisation des effets de taille et/ou de croissance pour analyse normative et identification de paramètres « candidat
marqueur »
– modélisation multimarqueur (classifieur, prédicteur…) incluant l’ensemble des résultats du projet ANDIMBA sur la base d’outils d’apprentissage informatisé
Activités associées :
• Contribution à l’étude d’autres paramètres ou structures neuroanatomiques (noyaux gris)
• Contribution éventuelle à l’encadrement des stagiaires en M2 du programme
• Contribution à la rédaction et publication d’au moins un article scientifique sur ces travaux
Spécificité(s) / Contrainte(s) du poste :
Site d’exercice : principalement à NeuroSpin (CEA-Saclay, Gif/Yvette), potentiellement à l’INT (Marseille) sous forme de mission, très accessoirement à hôpital Robert-Debré (Inserm U1141 NeuroDiderot, Paris 19e ), télétravail selon réglementation de l’Inserm.
Diplômes requis :
Ingénieur avec M2 de recherche / Stage M2 ou fin d’étude d’ingénieur en traitement d’images cérébrales humaines ou animales ou biomédicales
Compétences requises :
Connaissances : • Modélisation mathématique et statistique générale (niveau ingénieur) • appliquées, en particulier neuroanatomie – neuroimagerie humaine (généralités) /Savoir-faire : • Programmation langage Python (autonome), environnement Linux (autonome) • Communication scientifique, y compris illustration (niveau prédoctoral) • Anglais (niveau CECRL B2-C1) Aptitudes : • Aptitude au travail entre plusieurs équipes/interlocuteurs et plusieurs tâches concomitantes • Bonnes capacités d’autonomie et d’organisation
Rémunération :
Selon barème Inserm (contractuel)
Structure :
Emploi-type : Ingénieur de recherche
Code unité : Inserm UMR1141 NeuroDiderot (RNSR 200516362T) – équipe InDev (RNSR 201922979Z)
Intitulé : Maladies neurodéveloppementales et neurovasculaires – Imagerie et neurologie du
développement du cerveau (Imaging neurodevelopmental phenotypes)
Responsable : Pierre GRESSENS – Lucie HERTZ-PANNIER
Délégation : Régionale DR P7
Date souhaitée de prise de fonctions : Novembre à janvier 2023