FLI
Vous trouverez dans cette rubrique les offres de stage, de thèses, de post doctorats, de CDD et CDI à pourvoir dans les laboratoires partenaires du réseau.
Liste des annonces
Ingénieur en mesures physiques, instrumentation et techniques expérimentales CDD de 3 ans
Les contraintes économiques et sociétales nouvelles exigent une conception plus rationnelle et des méthodes alternatives de synthèse, de formulation et de mise en forme des polymères pour répondre aux besoins d'une plus grande durabilité et d'une gestion plus vertueuse de leur fin de vie, tout en maintenant des performances optimales en application. La découverte de nouveaux polymères entraînera de nouvelles méthodologies pour leur conception, leur transformation et l’évaluation de leurs propriétés à toutes les échelles d’analyse. Le développement récent des méthodes à haut débit (HTP) et d'intelligence artificielle (IA) ouvre d'énormes possibilités pour relever ces défis. Alors que de telles méthodes émergent en chimie, elles n'ont pas encore été mises en œuvre en France dans le domaine de la Science des Polymères. Ainsi, l’ingénieur(e) recruté(e) aura en charge de développer la plateforme d’élaboration et de caractérisation haut débit qui permettra la synthèse HTP et la méthode de caractérisation mises en œuvre à l'échelle moléculaire, macromoléculaire et des matériaux. Les données issues de l'analyse HTP seront utilisées pour alimenter des approches d'apprentissage automatique afin de déterminer la meilleure combinaison avec les multiples propriétés ciblées.
MISSIONS :
L’ingénieur(e) recruté(e) sera en charge de monter la plateforme des méthodes haut débit :
-Recherche des équipements HTP commerciaux existants
-Gestion des approvisionnements et des relations avec les fournisseurs
-Conception, montage et adaptation de dispositifs expérimentaux
-Coordination et conduite d’expérimentations
-Rédaction de procédures d’utilisation et de rapports d’analyse
-Formation des utilisateurs à la mise en œuvre des dispositifs expérimentaux et au respect des règles d’hygiène et sécurité
-Gestion et maintenance des équipements
-Participation aux projets de recherche attachés à la plateforme
Postdoctoral researcher position at IRCM Montpellier
High-grade serous ovarian cancer (HGSOC) is the most common subtype of ovarian cancer. For the initial management, no personalized interventions have been established, while HGSOC is very heterogeneous. There is a critical need for new biomarkers that capture this heterogeneity and support new target discovery for individualized therapy. Limitations in time and space of invasive biopsies might be overcome by imaging. Radiomics has the potential for “whole tumor virtual sampling” using non-invasive examinations [1]. To date, no study has evaluated the value of MRI radiomics at macroscopic and microscopic scales to examine whether radiomics habitats are underpinned by tumor biology in HGSCO. This project MR O MICS, funded by an ERC Sarting Grant, aims at developing radiomics signatures and evaluating their associations with tumor heterogeneity. It will also investigate if radiomics allow the identification of distinct tumor areas that may underpin tumor biology.
The "Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier" (IRCM - U1194) is a research centre located on the Val d'Aurelle Hospital Campus of the Montpellier Regional Cancer Institute (ICM). The institute is represented by a major theme and two unifying programs: molecular targets and cancer therapies. Research projects in basic and translational biology are carried out in close collaboration with the clinical services and the clinical research department of ICM. The IRCM is constituted to 16 teams and 205 people.
The team is working as well in close collaboration with the Micro Imaging platform which include one vertical 4T, one 3T,one 9.4T and a nanoPETCT.
Start date November 2023
References :
[1] Tardieu, Marion, et al. "Assessing histology structures by ex vivo MR microscopy and exploring the link between MRM-derived radiomic features and histopathology in ovarian cancer." Frontiers in Oncology (2022): 5424.
Ingénieur-e de recherche en imagerie multimodale préclinique CDD
Mission principale :
La personne recrutée aura pour mission d’assurer la conception et l’adaptation de protocoles expérimentaux mettant en œuvre l’IRM et le microTEP/CT.
Activités principales :
• Etudier les besoins en relation avec les objectifs de recherche, évaluer et proposer des stratégies d’étude et méthodes de caractérisation ou d'observations adaptées
• Discuter de cahier des charges fonctionnelles avec les utilisateurs et rédiger le cahier des charges techniques des projets d’imagerie
• Organiser le suivi de la réalisation des projets d’imagerie, valider et qualifier la ou les méthodologies à mettre en œuvre aux différentes étapes de réalisation (revues de projets)
• Conduire la consultation pour la réalisation du projet expérimental en imagerie du petit animal
• Piloter la réalisation des mesures, les interpréter et les valider
• Gérer l'ensemble des moyens humains, matériels et financiers alloués aux expériences
• Assurer la gestion, le maintien opérationnel des systèmes et le développement de l'imagerie du petit animal dans l’unité (IRM et microTEP/CT prioritairement)
• Former, informer, conseiller, sur les principes et la mise en œuvre des dispositifs expérimentaux
• Exercer une veille sur les évolutions technologiques du domaine
• Assurer la sécurité de fonctionnement du système
• Gérer en discussion avec la responsable de service l’ensemble des ressources humaines, techniques et financières allouées au service
• Présenter, diffuser et valoriser les résultats expérimentaux
• Participer à la gestion du service d’exploration non invasive du CREFRE en prenant part activement au maintien de son système documentaire qualité
• Assurer la surveillance du bien-être animal dans le cadre des protocoles d’imagerie
Spécificité(s) et environnement du poste :
• Expérimentation sur le petit animal
• Manipulation de sources radioactives non scellées, scellées et générateurs de rayons X
• Travail en environnement confiné
• Horaires flexibles selon les contraintes du service
• Astreintes weekends possibles
Stage M2 à l’IHU ICAN
Le plateau d’imagerie de l’IHU ICAN est un plateau d’imagerie multimodale comportant une plateforme d’acquisition IRM cardiovasculaire et un core lab de management et de traitement d’images (IRM et scanner). Le plateau d’imagerie travaille conjointement avec le laboratoire d’imagerie biomédicale (LIB UMR 1146) et l’unité d’imagerie cardiothoracique (ICT) de l’hôpital de la Pitié-Salpêtrière.
Un sujet de stage de Master 2 en gestion de bases de données est proposé par l’IHU ICAN, institut hospitalo-universitaire à Paris et le Laboratoire d’Imagerie Biomédicale (LIB) de Sorbonne Université (SU), INSERM et CNRS.
Ce stage traitera de problématiques d’archivage et accessibilité d’images et de biomarqueurs IRM et scanner au core lab d’imagerie (localisable, accessible, interopérable et retrouvable) issues des protocoles de recherche.
Pour cela, nous proposons de mettre en place une base de données, qui permettra d’accueillir les données issues des différents protocoles de recherche et de gérer leurs droits d’accès conformément aux règles RGPD en cours. Nous proposons d’extraire et publier les métadonnées pertinentes permettant de rendre ces données localisables et retrouvables. Enfin, pour faire le lien avec les traitements qui peuvent être lancés sur ces données, la base de données sera interconnectée avec les différents logiciels d’analyse de données.
Contrat postdoctoral en IRM quantitative des hépatopathies stéatosiques
Vous travaillerez dans le “laboratoire des biomarqueurs en imagerie” sous la supervision du Pr. Bernard Van Beers et du Dr. Philippe Garteiser. Vous serez en interaction directe avec les physiciens et les radiologues de l’équipe et travaillerez dans un consortium de recherches comprenant des hépatologues, gastro-entérologues et anatomopathologistes hospitalo-universitaires, ainsi que des biologistes et des mathématiciens. Le travail sera effectué à Paris (faculté de médecine Bichat, Université Paris Cité) et Clichy (hôpital universitaire Beaujon, AP-HP). Vous aurez accès à des plateformes de recherche en imagerie comprenant deux IRM 7T précliniques, une IRM clinique 3T, des appareils TEP-IRM clinique et préclinique et vous pourrez également travailler sur des plateformes de biologie moléculaire et cellulaire. L'équipe a de nombreuses collaborations nationales et internationales et offre un environnement stimulant, centré sur la translation clinique.
Contrat : Le/la candidat(e) sera employé(e) par l’Inserm sur base d’un contrat annuel, renouvelable. La rémunération sera basée sur l’expérience du/de la candidat(e).
Assistant-e ingénieur-e en centre d’expérimentation animale
Assurer la gestion de l'animalerie et le maintien de conditions matérielles optimales dans un contexte d'éthique, d'hygiène et de sécurité des personnes et des animaux
Activités :
-Surveiller l’état de santé et l’état sanitaire des animaux et administrer les traitements nécessaires
-Observer le comportement des animaux et réaliser des mesures
-Suivre les conditions éthiques d’utilisation des animaux (bonnes pratiques animales : fréquence d’observation, prise en compte des signes cliniques, traitement thérapeutique euthanasie)
- Appliquer et faire appliquer la règlementation concernant l’éthique et les bonnes pratiques animales
-Gérer l’entrée et la sortie des animaux
-Gérer l’occupation des armoires ventilées
Assurer l’interface technique et scientifique avec les équipes de recherche (préparer les expériences : animaux et matériels, prendre en charge les opérations de base : préhension, injections, soins pré ou post-manip, prélèvements). Appliquer et faire appliquer la règlementation concernant la gestion des déchets chimiques et biologiques
-Contrôler les lieux d’hébergement des animaux et remédier aux dysfonctionnements
-Gérer les stocks et commandes des consommables : alimentation, hygiène, matériels de chirurgie, pharmacie
-s’investir dans des structures locales d’éthique et du bien-être animal
TECHNICIEN EN EXPERIMENTATION PRECLINIQUE H/F CDD
Domaine : Biologie, biophysique et biochimie
Contrat : CDD
Intitulé de l'offre : TECHNICIEN/NE EN EXPERIMENTATION PRECLINIQUE H/F
Statut du poste : Non Cadre
Durée du contrat (en mois) : 13 mois
Le candidat aura pour mission d’aider à la réalisation du projet notamment il participera à la réalisation d’expérimentations in vivo dans le cadre de protocoles précliniques ainsi qu’aux analyses in vitro, ex vivo et in vivo telles que :
- Analyses ex vivo (prélèvements sanguins, biodistribution, coupes au microtome pour l'examen au microscope autoradiographie, immunohistologie, détermination de métabolites par radio-HPLC, dosages des traceurs par LC/MS),
- Réalisation des sessions d’imagerie préclinique (tomographie par émission de positrons, Tomodensitométrie),
- Culture et entretien de lignées cellulaires en milieu confiné L2,
- Contribution à la gestion du laboratoire et de la plateforme préclinique,
- Organisation des données d’imagerie et traitement d’images.
Technicien en expérimentation animale / Technicien en imagerie du vivant
RÉSUMÉ DU POSTE :
L'agent a pour mission principale de réaliser des procédures expérimentales sur le petit animal établies pour la plateforme d'imagerie à rayon X, Micro-CT hébergée par le laboratoire URP2496.
PRÉSENTATION DE LA DIRECTION/STRUCTURE D'ACCUEIL DU POSTE :
Composante de la Faculté de Santé de l'Université Paris Cité, l'UFR d'Odontologie a donné dès son édification, à la recherche biomédicale, une place prépondérante en créant et en soutenant le développement de laboratoires au sein desquels les enseignants et les étudiants participent à des projets de recherche clinique fondamentale. L'UFR d'Odontologie Université Paris Cité est l’une des quinze UFR d'odontologie de France.
DESCRIPTIF DES ACTIVITÉS :
- Effectuer des expérimentations sur animaux en respectant le protocole préétabli ;
- Acquisitions sur animaux vivants ou échantillons et traitement des données Micro-CT ;
- Surveiller statuts sanitaires et de santé des animaux et faire administrer les traitements prescrits ;
- Préparer et traiter des échantillons en vue de leur analyse par imagerie à rayon X ;
- Appliquer les réglementations du domaine d'étude ;
- Recueillir et mettre en forme les informations nécessaires à la bonne conduite de l'expérimentation ou requises par la législation ;
- Tenir un cahier de laboratoire et rédaction de protocoles ;
- Gérer les stocks et les commandes ;
- Assurer l'entretien et la maintenance de premier niveau du matériel et des équipements ;
- Participation à la gestion administrative de l'animalerie (logiciel, stocks, médicaments, saisine APAFIS...).
Encadrement : Oui
Conditions particulières d'exercice
- Utiliser les appareillages dédiés nécessaires (Micro- CT haute résolution, appareil anesthésie isofluorane...)
- Utiliser les logiciels liés aux techniques d'analyse des images.
Chef(fe) de projet ISEULT
La mission du (de la) chef(fe) de projet, à l’orée de la mise en exploitation de l’IRM, prendra plusieurs
aspects :
Planification du projet : Mise à jour des plannings (court terme - semaine, moyen terme - 1 an, long terme - 5 ans) après discussion avec les experts "aimant" de l’IRFU et "imagerie" METRIC.
Reporting : Rendre compte des avancées du projet en interne et en externe en préparant et animant les COPIL (Comité de Pilotage réunissant les partenaires du projet) et les réunions inter-instituts CEA, ainsi qu’en élaborant le rapport requis par la BPI, financeur du projet.
Gestion de projet : assister le pilote stratégique dans le bon déroulement du projet et sa coordination globale, assurer le suivi budgétaire, et le présenter devant la hiérarchie du CEA.
Actions de communication : en lien avec les responsables communication et le Service Presse CEA, diffuser régulièrement des informations dans « la lettre de l’Institut Joliot » ( Institut de recherche auquel appartient NeuroSpin) , au travers de faits marquants aux étapes importantes du projet, et préparer les évènements associés au projet avec les directions impliquées (ex : la première image chez l'homme).
Aspects réglementaires : l’objectif à court terme reste d’obtenir l’autorisation des organismes certificateurs pour l’imagerie sur l’homme à cette intensité de champ magnétique. Le(La) chef(fe) de projet aura un rôle essentiel dans la production de ce dossier et son suivi tout au long de la procédure en faisant en particulier le lien entre les différents intervenants participants à la production des justificatifs en interne : physiciens, biologistes, médecins, personnels administratifs du CEA, et en externe - CRO (Contract Research Organization) prestataire de service pour le projet, et les autorités décisionnaires sur ce dossier : ANSM (Agence Nationale de Sécurité du Médicament et produits de santé) et Comité de Protection des Personnes (CPP) sous la direction du médecin responsable. Une fois cette autorisation obtenue, le(la) chef(fe) de projet sera aussi en première ligne pour rédiger le premier protocole de recherche clinique puis de le maintenir ou de le faire évoluer.
Maintenabilité du système : le(la) chef(fe) de projet sera en charge d’entretenir une relation étroite avec l’IRFU, Siemens Healthineers (fournisseur de l’instrumentation RMN) et l’équipe plateforme de NeuroSpin (dont la cellule maintenance) afin de maintenir l’appareil en opération. Cela implique également le suivi des contrats de maintenance des équipements d’imagerie et
leur renouvellement.
Gestion et suivi des Procédures Achats : L’évolution de l’instrumentation d’ISEULT, soutenue par un financement EQUIPEX, impliquera des achats conséquents, le/la chef(fe) de projet ISEULT rédigera les cahiers des charges des appareils choisies/évolutions en collaboration avec les responsables de ce financement puis assurera, en lien avec le service commercial du CEA le suivi de ces dossiers, les procédures achats, et fera évoluer les contrats de maintenance induits le cas échéant. Au fur et à mesure que le système rentrera dans une phase d’exploitation normale, le poste évoluera avec de nouvelles missions :
D’abord celle de renforcer les collaborations existantes et développer de nouveaux partenariats industriels et académiques afin de soutenir la rédaction de réponses aux appels à projets européens tels que le programme Horizon Europe (dont ERC, IEC Pathfinder, etc...) ou ANR, en d’autres termes participer à la création d’une dynamique porteuse de nouveaux projets de recherche avec le responsable scientifique du programme. Cela peut vouloir dire mettre en place des contrats de collaboration, en lien avec le service juridique du CEA, et suivi des projets.
Il s’agira aussi et d’animer la communauté des utilisateurs d'Iseult (organisation des réunions régulières et d'intérêt général sur Iseult). De plus, le (de la) chef(fe) de projet mettra en place des formations techniques destinées aux chercheurs de NeuroSpin mais également aux équipes extérieures qui seront amenées à travailler sur l’IRM à 11.7T afin de faciliter le démarrage d’études sur ce système et de garantir la qualité des résultats obtenus.
Ensuite, selon le parcours professionnel et les compétences du (de la) titulaire, d’autres voies seront possibles ; Par exemple, il serait possible qu’il/elle mette en place son propre projet de recherche en symbiose avec les activités des physiciens de l’équipe METRIC.
Ingénieur de Recherche en IRM CDD
Vous participerez à la conception, l’optimisation et la mise en place des protocoles expérimentaux ainsi qu'à l’acquisition et l’analyse à des données.
Vous développerez une expertise des outils logiciels existants adaptés à l'analyse des données IRM produites sur la plate-forme et participerez à l’exploitation et à l'évolution de dispositifs expérimentaux du plateau IRM 3T.
Vous travaillerez en collaboration et sous l'autorité de Laurent LAMALLE, physicien spécialisé en IRM, en concertation avec le Professeur Alexandre KRAINIK, neuroradiologue responsable de la composante clinique et cognitive et également en collaboration avec J. WARNKING, chercheur physicien spécialiste IRM, J. PIETRAS, L. MIQUEL, ingénieur hospitalier et manipulatrice en électroradiologie et Éric CONDAMINE, Ingénieur de Recherche "développements logiciels / traitement d'images".
Activités principales :
- Vous participerez à la conception et à la mise en place des protocoles de recherche et pour cela,
vous participerez à l'optimisation des acquisitions, de leur analyse, à la validation du protocole.
vous étudierez les besoins scientifiques, proposerez les techniques et méthodes de mesure, de caractérisation ou d'observations adaptées.
vous étudierez les projets et conseillerez les utilisateurs pour assurer la faisabilité du protocole en analysant les contraintes expérimentales et proposerez les adaptations et évolutions nécessaires de la chaîne expérimentale.
vous participerez au développement de séquences d’acquisition IRM (après formation spécifique).
vous participerez au développement ou à l'intégration des systèmes expérimentaux de la plate-forme (typiquement : périphériques compatibles IRM, voire scanner IRM lui-même).
- Vous participerez aux acquisitions et les encadrerez :
vous formerez à l’utilisation des dispositifs expérimentaux.
vous analyserez, interpréterez, validerez les données.
vous vous impliquerez scientifiquement dans l’analyse des données des utilisateurs.
vous participerez à et encadrerez la sauvegarde des données.
- Vous suivrez et rapporterez le déroulement des protocoles :
vous maintiendrez à jour le tableau de bord du déroulement des protocoles.
vous veillerez au fonctionnement et à la sécurité des dispositifs expérimentaux.
- Vous participerez au développement d'une expertise dans l'analyse des données produites sur la plate-forme :
- Vous explorerez et évaluerez des données acquises sur la plate-forme et des outils de traitement adaptés à ces données.
vous participerez à la veille scientifique et technologique et sa structuration, en particulier concernant les outils de traitement et analyse d’images et de signaux utiles à la plate-forme et à ses utilisateurs, vous conseillerez ceux-ci.
vous définirez des « pipelines » de traitement de référence, proposerez des solutions d’analyse « clés en main » et « à l'état de l'art » des données produites sur la plate-forme adaptées aux hypothèses de recherche de ses utilisateurs.
vous intégrerez certains « pipelines » de traitement identifiés comme prioritaires dans un environnement en rendant l’usage abordable par d’autres utilisateurs. Vous participerez au développement des services de traitement et d’analyse d’images et de signaux.
En fonction des demandes des utilisateurs (cliniciens, chercheurs ou industriels), vous irez jusqu’à vous impliquer scientifiquement dans l’analyse de leurs données.
- Vous présenterez, diffuserez et valoriserez les réalisations du plateau.
- Vous serez amener à interagir avec les ingénieurs des plateaux analogues en France et à l'international.