FLI
Vous trouverez dans cette rubrique les offres de stage, de thèses, de post doctorats, de CDD et CDI à pourvoir dans les laboratoires partenaires du réseau.
Liste des annonces
Preclinical Imaging Research Scientist (M/F)
We offer:
▪ A position in an international company working on medicinal products with high added value.
▪ An extremely stimulating field of research within a scientific environment highly specialized and qualified.
▪ A working environment with state-of-the-art technologies
▪ Flexible working time with possibility of home office
▪ A challenging job with means to succeed and possibilities for education and training programs.
The following missions will be devoted to the laboratory manager :
▪ Be responsible for managing the “Therapeutic Ultrasound” laboratory in accordance with company requirements and in compliance with ethical standards.
▪ Design and supervise experimental work of research scientists/research associates to investigate in vivo the therapeutic efficacy of ultrasound combined with gas microbubbles.
▪ Scientific and technological watch, identification of opportunities and implementation of new technological ideas in relation with preclinical/clinical therapeutic application.
▪ Motivated by the development of new ideas / innovation: manage the drafting of Disclosure of Invention and Patent application.
▪ Management of report writing and scientific reporting (reports, scientific manuscript, poster or oral presentations during congresses and symposia).
▪ Responsible to implement laboratory infrastructure (material acquisitions, new technology, development of methods) and Health, Safety and Environment rules in the laboratory.
▪ Be able to defend new idea/project under his/her responsibility in front of different audiences: at Geneva site and at GR&D levels.
▪ Be able for a specific research project, to define objectives, conduct project meetings and monitor activities according to set timelines.
▪ Be able to manage collaborations with industrial or academic partners (Swiss or International) and contract negotiation.
Thèse sur la conception d’un agent radiomarquable universel sélectif pour l’imagerie TEP et le traitement par RTIV
L'imagerie moléculaire, en particulier l’imagerie de tomographie par émission de positons (β+) (TEP) est devenue indispensable au diagnostic de nombreuses maladies comme les cancers. L'essor de cette technique non invasive est lié à l’obtention d’images tridimensionnelles, après injection d’un radiotraceur, permettant de localiser et quantifier des cibles spécifiques à la pathologie. Les radiotraceurs sont également employés pour le traitement de cancer par radiothérapie interne vectorisée (RTIV). Ces radiotraceurs associent majoritairement un agent de ciblage, interagissant avec un biomarqueur de la pathologie, et un agent chélatant complexant un radionucléide permettant l'enregistrement d'images. Récemment une nouvelle technique de radiomarquage au fluor-18 par chimie de complexation (i.e., formation du complexe d'aluminium-fluor-18) a vu le jour et est devenue une technique de choix pour le développement de nouveaux radiotraceurs. En fonction de la nature des agents chélatants, différents radionucléides peuvent être complexés par les traceurs. Le fluor-18 (18F) et le gallium-68 (68Ga) sont des radionucléides de choix pour l'imagerie TEP et le lutétium-177 (177Lu) pour la RTIV, mais ces trois radionucléides possèdent des propriétés de complexation différentes. Ainsi, l’aluminium-fluor-18 peut être complexé par des agents chélatants de types HBED-CC et NOTA, le gallium-68, par des agents chélatant de types HBED-CC, NOTA et DOTA et le lutécium-177, par des agents chélatant de type DOTA.
L’objectif de ces travaux de thèse est d'optimiser la structure chimique d'un nouvel agent chélatant bifonctionnel (ACB), développé au cours d'une thèse précédente, pouvant être (i) radiomarqué à l’aluminium-fluor-18, au gallium-68et au lutécium-177 par chimie de complexation, et (ii) couplé à des peptides de ciblage par bioconjugaison. Le but est de préparer des « peptides-chélatants » pouvant être utilisés en imagerie TEP et en RTIV pour une application en théranostic (thérapie + diagnostic) s’insérant dans une démarche de médecine personnalisée.
Methodological developments in micro-MRI and NMR spectroscopy
MISSION
The engineer will conduct research in MRI, principally at 11.7T on an NMR spectrometer equipped
with a micro-imaging probe:
- for the in vitro and in vivo study of animal models such as Zebrafish, complex cellular systems (organoids,
3D cultures) or for the ex vivo study of fresh or fixed tissues
- for the study of bio sourced gels based on polysaccharids (starch, arabinoxylanes) or protein (corn zein) in order to conceive bio polymer matrices with controlled functionalities allowing, for example, the liberation of active principles initially contained in these matrices. This research work contains several interconnected contributions:
WP1: Elaboration of experimental set-ups adapted to the study of multicellular systems, and zebrafish larvae.
WP2: Validation of the sequences adapted to the study of multicellular systems, zebrafish larvae and tissues.
Adaptation of the protocols for the in vivo imaging of the zebrafish.
WP3: Optimization of the study of dynamic monitoring of functional bio sourced matrices. Implementation of the study of dynamic monitoring of functional bio sourced matrices.
The candidate will need an ability to imagine and conceive experimental plans adapted to the study of multicellular systems, zebrafish larvae (WP1) and hydrogels whose shape/form evolves through time (WP3). The candidate will carry the realization of the experiments with the MRI (WP2 and WP3), their interpretation and traceability, from data to analysis reports, and their valorization in communications in conferences and articles in scientific journals.
Développements méthodologiques en micro-IRM et en spectroscopie par RMN
Description du service et place de l’agent dans l’organisation :
(mission de l’unité, responsable hiérarchique, environnement, contraintes)
L’ingénieur(e) de recherche recruté(e) sera rattaché(e) à l’UAR Biosit qui gère 14 plateformes dont la Plateforme de Recherche en Imagerie et Spectroscopie Multimodales PRISM, (https://www.pf-prism.org/) qui propose des solutions d'imagerie et de spectroscopie pour une large gamme d’applications, allant du secteur biomédical jusqu’à l’agroalimentaire en passant par la chimie. PRISM dispose de 4 imageurs par Résonance Magnétique (IRM 1.5T, 4.7T, 7T and 11.7T), 2 spectromètres de RMN à haut champ (2 x 500MHz) et 6 relaxomètres (0.35T et 0.47T). PRISM fait partie du réseau des plateformes technologiques du Grand Ouest en sciences du vivant et de l’environnement Biogenouest (https://www.biogenouest.org/) et de l’infrastructure nationale de recherche “France Life imaging”. PRISM est certifié ISO 9001 : v2015.
Le (la) candidat(e) intégrera la plateforme PRISM, en particulier la composante Bio-SCANs sur le site de
Villejean incluant de fortes interactions avec la composante Agro-SCANs de Beauregard (UR OPAALE,
INRAE). Il (elle) travaillera dans le cadre d’un projet dont l’objectif est de développer de nouvelles méthodes
en IRM et en spectroscopie de RMN de façon parallèle, sur la sonde de micro-imagerie de la plateforme
PRISM. Cette double approche bénéficiera de l’expertise et du savoir-faire déjà existants sur la plateforme
des deux modalités (imagerie et spectroscopie) dans le domaine du médical (Bio-SCANs) et de la science
des matériaux (Bio-RMN et Agro-SCANs).
Missions et activités:
Mission : L’ingénieur(e) mènera des recherches en IRM principalement à 11,7T sur un spectromètre de RMN équipé d’une sonde de micro-imagerie :
- pour l’étude in vitro et in vivo de modèles animaux de type Zebrafish, de systèmes cellulaires complexes (organoïdes, cultures 3D) ou pour l'étude ex vivo de tissus frais ou fixés ;
- pour l’étude de gels biosourcés à base de polysaccharides (amidon, arabinoxylanes) ou d’une protéine (zéine de maïs) dans l’optique de concevoir des matrices de biopolymères à fonctionnalités contrôlées permettant par exemple la libération de principes actifs pharmaceutiques initialement encapsulés dans ces matrices.
Ce travail de recherche comporte plusieurs contributions, qui s’auto-nourrissent :
WP1 : Mise au point de dispositifs expérimentaux adaptés à l’étude des systèmes multicellulaires, et de larves de zebrafish.
WP2 : Validation des séquences adaptées à l’étude des systèmes multicellulaires, de larves de zebrafish et de tissus. Adaptation des protocoles pour l’imagerie in vivo des zebrafish.
WP3 : Optimisation des études de suivi dynamique des matrices biosourcées fonctionnelles. Mise en œuvre des études de suivi dynamique des matrices biosourcées fonctionnelles.
Le(la) candidat(e) aura une capacité à imaginer et concevoir des dispositifs expérimentaux adaptés à l’étude des systèmes multicellulaires, de larves de zebrafish (WP1) et d’hydrogels dont la forme évolue dans le temps (WP3). Il(elle) portera la réalisation des expérimentations en IRM du WP2 et WP3, leur interprétation et leur traçabilité, de la donnée à l’analyse sous forme de rapports, et leur valorisation sous forme de communications dans des congrès et d’articles dans des revues scientifiques.
Post-doctoral position in Medical Image Processing (18 months)
The Computer-Assisted Medical Interventions (CAMI) team of the TIMC laboratory (Grenoble, France) is
looking for a highly motivated postdoctoral candidate with a strong background in medical image processing
(registration and segmentation) and experience in deep learning approaches with a focus on ultrasound imaging.
The candidate will work on the development of a multimodal deep learning registration method between pre-
operative 3D MR images and intraoperative 3D transrectal ultrasound images. This method should be able to
provide a deformation eld to link the two images. The candidate will be expected to publish his/her research
in leading international journals and conferences in the eld, participate in the supervision of PhD students and
contribute to the collaborative projects within the laboratory.
The TIMC laboratory is located minutes away from the Grenoble University Hospital, allowing for a close and
effective collaboration with clinical & industrial partners. Grenoble is a welcoming student city at the heart of
the French Alps.
DURATION : 18 months (as soon as possible from 01/2023)
Post-Doctoral Position on Development of a 3D platform for Passive Acoustic Mapping of cavitation
CONTEXT
Therapeutic ultrasound offers great perspectives for minimally invasive surgery, enhanced drug delivery or cancer immunotherapy. It now addresses an extensive range of indications, from prostate or brain tumors to glaucoma. Among other mechanisms, various emerging applications rely on the phenomenon of ultrasound cavitation, which represents the oscillation of ultrasound-induced microbubbles. In any of these applications, monitoring the treatment in real-time is required for potential clinical applications. While active ultrasound B-mode imaging is well suited to monitor thermal or mechanical permanent alteration of tissues, the microbubble activity – directly actuated by high-intensity ultrasound – cannot be characterized in real-time using an active ultrasound scanner because of dazzling effects.
To localize and quantify the cavitation activity, Passive Acoustic Mapping (PAM) beamforming techniques have been used, but they suffer from weak spatial resolution in the axial direction, perpendicular to the array, when conventional imaging arrays are used. This is even more critical for applications requiring a 3D monitoring of the cavitation activity. Indeed, even if a few works have demonstrated the feasibility of 3D passive acoustic mapping of cavitation, especially in the context of transcranial therapy with very specific hemispherical arrays, 3D mapping with conventional matrix arrays suffers from very low axial resolutions due to diffraction effects associated to the low apertures of the probes. Adaptive beamformers have proven to be an effective way to enhance PAM resolution but do not entirely compensate for those diffraction effects and complimentary research avenues such as dual array mapping have to be considered to achieve millimetric or sub-millimetric resolutions in any direction.
MISSION
Within the CAVIIAR ANR Project framework, the candidate will have to evaluate the feasibility of a dual-probe
mapping based on two commercial matrix arrays with electromagnetic tracking of their positions. He will then develop a 3D navigation and imaging platform combining one or two open ultrasound scanners connected to two matrix arrays, a tracking unit giving translational and rotational data of each probe, a 7-axis robot that will give reference positions of the probes in an evaluation step, and a 3D navigation station providing tools for communication with other devices, reconstruction and visualization in a 3D virtual environment with fusion capability of active and passive US images. The platform will aim at providing dual-array 3D PAM of cavitation events triggered in agar-based phantoms with millimetric or sub-millimetric resolution in any direction using two commercial matrix-array probes.
Poste de chaire de professeur.e junior en Innovation en neurotechnologie
L'Inserm en partenariat avec Sorbonne Unviersité propose au sein du Laboratoire d'Imagerie Biomédicale (LIB, U1146) un poste de chaire de professeur.e junior en Innovation en neurotechnologies pour une meilleure probabilité de dispositifs médicaux.
Afin de renforcer les recherches dans ce domaine au sein du LIB, nous recherchons un profil de chercheur/chercheuse en sciences des données appliquées au traitement des signaux et images.
La date limite de candidature est fixée au 14 avril 2023 (13h). Toutes les informations à l'adresse : https://www.lib.upmc.fr/chaires-inserm-2023-rejoignez-lequipe-ncp/
Ingénieur-e en neuro-imagerie : Ingénieur-e en charge du traitement et de l’analyse de bases d’images issues de protocoles de recherche pré-clinique.
Activités :
• Formaliser les besoins en traitement d'images des chercheurs, doctorants
• Concevoir et développer des méthodes d’analyse d’images IRM (fonctionnelle, de diffusion, etc.) pour répondre aux besoins exprimés
• Assurer le traitement de données issues de protocoles de recherche pré-clinique via les chaînes de traitements développées jusqu'à la présentation et l'aide à l'interprétation des résultats obtenus
• Transférer des développements méthodologiques pour l’analyse de données issues des équipes de recherche d’ICube (IMIS, IMAGeS)
• Adapter, optimiser et mettre en œuvre les traitements pour des moyens de calcul intensif
• Gérer le cycle de vie des données en entrée et en sortie des chaînes de traitements
• Accompagner les utilisateurs lors de l’analyse et l'interprétation des résultats
• Assurer la documentation et la maintenance des méthodes et outils développés
• Former les personnels (chercheurs, doctorants, etc..) à l'utilisation de bibliothèques de traitement d'images biomédicales
• Assurer une veille technologique et scientifique
Contrat :
CDD de 1 an, reconductible.
Temps complet.
Salaire à partir de 2400€ brut mensuel, ajustable selon l’expérience.
Prise de fonctions dès que possible
Associate Professor in Computer Assisted Medical Interventions – CAMI
Eco-system and context :
IMT Atlantique internationally recognized for the quality of its research, is a leading technological university under the authority of the Ministry of Industry and Digital Technologies, ranked in the three main international rankings (THE, SHANGHAI, QS).
The position is open on the campus of Brest within the Image & Information Processing department.
IMT Atlantique has privileged relationships with major industrial national and international partners, as well as a dense network of SMEs, start-ups, and innovation networks. With 290 permanent faculty members, 2000 students among which 300 PhD students, IMT Atlantique produces every year 1000 publications and raises 18M€ of research funding.
The research activity is part of the Medical Information Processing Laboratory – LaTIM INSERM U1101, within the IMAGINE team, Axis "Data-based surgical management". He will therefore have access to the US Interventional Imaging Platform - Averoes and the Platform for the Design and Evaluation of Innovative Medical Devices - PLaTIMed.
Education :
The education program of IMT Atlantique has been recognized as amongst the most innovative in French High Education and Research and offers large possibilities of developing innovative engineering curriculum and educational approach.
The candidate will contribute to the teaching “Healthcare Engineering”. He will be invited to propose related new educational projects, programs and methodologies, especially inspired by and supported by industrial requirements and partnerships. He will be closely associated with future Digital Health training programs.
He will be invited to propose new projects, programs, and related pedagogical methodologies, particularly the development of pedagogical innovations: digital content, E-learning, mixed reality platform for immersive distance learning due to the constraints of the clinical setting. The recruited person may be required to teach in French and English.
Specifically, he will be involved in teaching related to "CAMI", "Medical devices and sensors", "Connected medical devices", relying on the platforms made available and promoting learning through practice and projects.
Documents to apply:
- Application file to download HERE
- CV + cover letter
- integration project on the 3 axes Teaching / Research / Development
- photocopy of identity card or passport
- photocopy of diplomas or a certificate of success
- report of the thesis defense
- reports from the two thesis jurors
- any other element that could support your application
Benefits :
-49 days of annual leave
- Possibility working at home
- Public transportation paid for
- Sustainable mobility package (for carpooling or cycling)
- Family supplement
- Wide range of social benefits
Maître de conférences (F/H) Gestes médicaux-Chirurgicaux Assistés par Ordinateur – GMCAO – CDI
IMT Atlantique, reconnue internationalement pour la qualité de sa recherche, est une grande d’école d’ingénieurs de premier plan sous la tutelle du ministère de l'industrie et du numérique, classée dans les trois principaux classements internationaux (THE, SHANGHAI,QS).
Le poste est ouvert sur le campus de Brest au sein du département Image & Traitement de l’Information – ITI.
IMT Atlantique entretient des relations privilégiées avec de grands partenaires industriels nationaux et internationaux, ainsi qu'avec un réseau dense de PME, de start-ups et de réseaux d'innovation. Avec 290 enseignants permanents, 2000 étudiants dont 300 doctorants, IMT Atlantique produit chaque année 1000 publications et lève 18M€ de fonds de recherche.
L’activité de recherche s’inscrit au sein du Laboratoire de Traitement de l’Information Médicale – LaTIM INSERM U1101 (https://latim.univ-brest.fr), dans l’équipe IMAGINE, Axe «Gestion chirurgicale basée sur les données ». Il aura de ce fait accès aux Plateformes d’imagerie interventionnelle US – Averoes et la Plateforme pour la conception et l’évaluation de dispositifs médicaux innovants - PLaTIMed, https://platimed.fr
Formation :
Le programme de formation d'IMT Atlantique a été reconnu comme l'un des plus innovants de l'enseignement supérieur et de la recherche en France et offre de larges possibilités de développement de programmes d'ingénierie et d'approches pédagogiques innovants.
La personne recrutée contribuera à différentes formations (ingénieur, master, aussi bien dans sa spécialité (« Ingénierie de la santé ») que dans des enseignements de tronc commun ou des activités transverses en lien avec le monde socio-économique : tutorat de projets / stages, soutenances, accompagnement, etc. Il/elle sera associé(e) étroitement aux nouveaux projets de formation.
Elle sera invitée à proposer de nouveaux projets, programmes et méthodologies pédagogiques connexes, particulièrement le développement d’innovations pédagogiques : contenus numériques, E-learning, plateforme de réalité mixte pour l’apprentissage immersif à distance du fait des contraintes du milieu clinique. La personne recrutée pourra être amenée à enseigner en français et en anglais.
De manière spécifique, il/elle s’impliquera dans les enseignements en lien avec les "GMCAO", "Dispositifs médicaux et capteurs", "Dispositifs médicaux connectés", en s’appuyant sur les plateformes mises à disposition et favoriser l’apprentissage par la pratique et les projets.
Documents pour candidater :
Dossier de candidature à télécharger - CV + Lettre de motivation projet d’intégration sur les 3 axes Enseignement / Recherche / Valorisation - photocopie de la carte d'identité ou du passeport - photocopie des diplômes ou une attestation de réussite - rapport de la soutenance de thèse - rapports des deux rapporteurs de thèse - tout autre élément pouvant appuyer votre candidature
Avantages :
49 jours de congés annuels et RTT - Télétravail partiel possible - Prise en charge des transports en commun - Forfait mobilité durable (pour le covoiturage ou les trajets à vélo) - Complément familial - Large gamme de prestations sociales
Mentions légales : Nature du contrat : CDI de droit public Les postes offerts au recrutement sont ouverts à toutes et tous avec, sur demande, des aménagements pour les candidats en situation de handicap - Emploi ouvert également aux fonctionnaires et contractuels de la fonction publique - Toute candidature peut faire l'objet d'un contrôle administratif