FLI
In this section, you will find internships, thesis, post-doctorates, fixed-term and permanent contract vacancies in the network’s partner laboratories.
Liste des annonces
2017/05/05 Software Engineer for Neuroimaging, Gif-sur-Yvette et Paris
The engineer will work on several of the technologies involved in the construction of CATI services: Linux, Python, Qt, Pyramid, PostgreSQL, REST web services, Apache, OpenSSH, etc.
Objectives :
The recruited person will work mainly on CATI data flow and data sharing, but also on production and data analysis tools. These data combine heterogeneous measurements from several acquisition modalities such as MRI, nuclear imaging, genotype, behavioral assessments and neuropsychological questionnaires.
The main work will consist in setting up the data flow of new studies as well as the maintenance and operation of the services for existing studies. In particular :
• Implementation of the De Novo project data flow.
• Creation of a data exposure service for this project.
• Participation in the development of CATI's IT tools.
2017/05/03 Chargé de travaux scientifiques (H/F)
Guerbet recrute un Chargé de travaux scientifiques (H/F) pour un CDD de 6 mois au sein du pôle d’imagerie et biologie.
Missions principales :
- Réalisation d’études chez l'animal (chirurgie / injection IV / prélèvements biologiques)
- Mise au point de modèles animaux pathologiques en oncologie (induction / suivi / biochimie / histologie)
- Réalisation d'imagerie chez le petit animal (mise au point de séquence IRM, acquisition et lecture des images) Compétences et connaissance dans le prélèvement de structures fine du cerveau de rat
- Pilotage technique d’une étude (rédaction du protocole/rapport, traitement statistique, analyse/synthèse des résultats)
2017/05/03 Chargé de travaux scientifiques (H/F)
Guerbet recrute un Chargé de travaux scientifiques (H/F) pour un CDD de 6 mois au sein du pôle d’imagerie et biologie.
Missions principales :
- Réalisation d’études chez l'animal (chirurgie / injection IV / prélèvements biologiques)
- Mise au point de modèles animaux pathologiques en oncologie (induction / suivi / biochimie / histologie)
- Réalisation d'imagerie chez le petit animal (mise au point de séquence IRM, acquisition et lecture des images) Compétences et connaissance dans le prélèvement de structures fine du cerveau de rat
- Pilotage technique d’une étude (rédaction du protocole/rapport, traitement statistique, analyse/synthèse des résultats)
2017/05/02 Ingénieur d’études « gestion et analyses des données de la stimulation cérébral profonde », Paris
L'Institut de Neurosciences Translationnelles de Paris recrute un(e) Ingénieur d’études « gestion et analyses des données de la stimulation cérébral profonde » (h / f) pour un CDD de 12 mois (recrutement dès que possible).
Le/la candidat(e) travaillera en étroite collaboration avec les équipes impliquées dans les procédures neurochirurgicales de stimulation cérébrale profonde sur le site de l’Hôpital Pitié-Salpétrière. Le poste est au service de la communauté des équipes de l’IHU. Il/elle participera à la gestion et aux analyses des données produites lors des procédures de stimulation cérébrale profonde (données d’imagerie et signaux électrophysiologiques).
Dans ce cadre, il/elle sera chargé(e) de :
- Recueillir, sauvegarder et centraliser les données d’imagerie provenant des procédures de stimulation cérébrale profonde
- Veiller à l’anonymat des données
- Lancer des pré-traitements sur les données d’imagerie :
o Application d’un atlas pour localiser les structures cérébrales chez le patient
o Fusion de données IRM multi-modales
o Préparation de scènes MRML dans l’environnement logiciel Slicer avec l’outil pyDBS
- Participer au développement de nouveaux scripts (python) de traitement
- Assurer la gestion et la maintenance des bases de données existantes (images et signaux électrophysiologiques)
- Remplir les bases de données existantes avec des données venant de sources différentes
- Tenir un cahier d’expérience
- Gérer la documentation technique
- Appliquer les règles de sécurité
2017/05/02 Ingénieur d’études « gestion et analyses des données de la stimulation cérébral profonde », Paris
L'Institut de Neurosciences Translationnelles de Paris recrute un(e) Ingénieur d’études « gestion et analyses des données de la stimulation cérébral profonde » (h / f) pour un CDD de 12 mois (recrutement dès que possible).
Le/la candidat(e) travaillera en étroite collaboration avec les équipes impliquées dans les procédures neurochirurgicales de stimulation cérébrale profonde sur le site de l’Hôpital Pitié-Salpétrière. Le poste est au service de la communauté des équipes de l’IHU. Il/elle participera à la gestion et aux analyses des données produites lors des procédures de stimulation cérébrale profonde (données d’imagerie et signaux électrophysiologiques).
Dans ce cadre, il/elle sera chargé(e) de :
- Recueillir, sauvegarder et centraliser les données d’imagerie provenant des procédures de stimulation cérébrale profonde
- Veiller à l’anonymat des données
- Lancer des pré-traitements sur les données d’imagerie :
o Application d’un atlas pour localiser les structures cérébrales chez le patient
o Fusion de données IRM multi-modales
o Préparation de scènes MRML dans l’environnement logiciel Slicer avec l’outil pyDBS
- Participer au développement de nouveaux scripts (python) de traitement
- Assurer la gestion et la maintenance des bases de données existantes (images et signaux électrophysiologiques)
- Remplir les bases de données existantes avec des données venant de sources différentes
- Tenir un cahier d’expérience
- Gérer la documentation technique
- Appliquer les règles de sécurité
2017/05/02- Post-Doctoral Fellowship in Multi-Parametric Imaging of Fat Metabolism
The Singapore Bioimaging Consortium (SBIC) is currently looking for post-doctoral candidates to participate in research projects including:
Quantitative high resolution imaging of white, brown and browning adipose tissues using Dixon Techniques, Relaxation Mapping, Diffusion, Perfusion, and fat composition using multi-nuclear methods (Ex. 1H, 13C, 31P, 23Na, 19F). The candidates will also have opportunities to participate in hybrid imaging of adipose tissues including MRI-PET and MRI-Optical methods. The successful candidate will also have the opportunity to broaden his/her scientific experience by participating in advanced multi-modal imaging research using small animal MRI/MRS scanners.
Facility and Equipment:
The core facilities include Bruker 9.4T Biospec, 11.7T equipped with cryocoil, Bruker 7T ClinScan MRI, Siemens 3T Skyra, Bruker 400 and 600 MHz NMR, HyperSense dynamic polarization system, PET-MR, PET-CT, and SPECT-CT scanners. For further information about SBIC, please visit our website: http://www.sbic.a-star.edu.sg/.
The successful candidate will also have the opportunity to broaden his/her scientific experience by participating in advanced multi-modal imaging research using small animal imaging systems and translational clinical research.
2017/05/02- Post-Doctoral Fellowship in Multi-Parametric Imaging of Fat Metabolism
The Singapore Bioimaging Consortium (SBIC) is currently looking for post-doctoral candidates to participate in research projects including:
Quantitative high resolution imaging of white, brown and browning adipose tissues using Dixon Techniques, Relaxation Mapping, Diffusion, Perfusion, and fat composition using multi-nuclear methods (Ex. 1H, 13C, 31P, 23Na, 19F). The candidates will also have opportunities to participate in hybrid imaging of adipose tissues including MRI-PET and MRI-Optical methods. The successful candidate will also have the opportunity to broaden his/her scientific experience by participating in advanced multi-modal imaging research using small animal MRI/MRS scanners.
Facility and Equipment:
The core facilities include Bruker 9.4T Biospec, 11.7T equipped with cryocoil, Bruker 7T ClinScan MRI, Siemens 3T Skyra, Bruker 400 and 600 MHz NMR, HyperSense dynamic polarization system, PET-MR, PET-CT, and SPECT-CT scanners. For further information about SBIC, please visit our website: http://www.sbic.a-star.edu.sg/.
The successful candidate will also have the opportunity to broaden his/her scientific experience by participating in advanced multi-modal imaging research using small animal imaging systems and translational clinical research.
2017/04/12- CDD (3 ans) -CHERCHEUR TRAITEMENT ET ANALYSE D’IMAGES
L’Institut de Recherche Biomédicale des Armées (IRBA) ouvre à partir du 1er septembre 2017 un poste de chercheur contractuel dans le domaine de l’imagerie et du retraitement et analyse d’images de microscopie bi-photonique et à fluorescence. CDD 3 ans renouvelable une fois avant CDisation.
Missions :
- Concevoir les méthodes d’acquisition et améliorer les protocoles d’acquisition des images in situ et in vivo,
- Compétence en optique,
- Concevoir, développer et exploiter des programmes de traitement et d’analyse d’images (segmentation, recadrage temporel et compensation de dérive, tracking de cellules/particules, reconstruction 3D, distribution et reconnaissance de forme, statistique en imagerie, etc),
- Assurer l’amélioration des programmes par l’écriture et l’implémentation d’algorithmes en fonction des besoins des projets de recherche.
2017/04/10 Research Engineer, Caen
The engineer will be in charge of the implementation of open access databases related to aging and neurodegenerative disease (e.g., ADNI, DIAN) within the team and of the development of new methods of (pre)processing neuroimaging data. More specifically, the engineer will have to set databases for use, implement quality control procedure for different imaging modalities (e.g., structural and functional MRI, PET) and connect together the different databases. Moreover, the engineer will be involved in the development of innovative processing and analyses techniques for one or several of the neuroimaging data modalities acquired in the lab (e.g., fMRI, DTI, ASL, PET imaging).
Duration : 12 to 36 months
Starting date : 01/06/2017
To apply : Send a CV, motivation letter and contact details of two academic referees
2017/01/19 Ingénieur en analyse et traitement d’images IRM, Caen
L’Etat de Repos chez le petit animal est un état cérébral mental physiologique particulier qui correspond aux périodes aux cours desquelles le cerveau fonctionne sans entrée, consigne ou sortie forcée. Ces périodes d’état de repos représentent une fraction notable de la période d’éveil, et peuvent aussi bien s’étendre sur de longues plages temporelles (plusieurs minutes) que durer de brefs instants. Outre l’intérêt que présente en soi la connaissance des bases neurales de cet état cérébral, celle-ci se révèle par ailleurs indispensable pour effectuer une analyse fine des données de neuroimagerie cognitive. En effet, en neurosciences cognitives et en neuroimagerie particulièrement, l’état de repos est fréquemment employé, explicitement ou implicitement, comme état de référence dans les paradigmes expérimentaux. Les bases neurales de cet état cérébral particulier font donc l’objet depuis quelques années d’un intérêt croissant.
Développements :
Le but de ce CDD est de fournir une toolbox informatique accessible pour faciliter les méthodes d’extraction de l’information sur une base de données d’imagerie. Cette mission s’articule donc autour des points suivants :
• Mise en place d’une structure de base de données relationnelle : description de la donnée, traçabilité des traitements, stockage des résultats.
• Automatisation des traitements d’images : recalage spatial, normalisation stéréotaxique, filtrage spatial et temporel, …
• Automatisation de l’analyse en composante indépendante (ICA) pour établir une cartographie cérébrale fonctionnelle.
• Développement d’outil de navigation dans les images : recalage manuel, superposition d’images, …
• Mise en place d’une représentation par graphe de la connectivité fonctionnelle sur la base de corrélation basse fréquence entre les différentes régions identifiées par l’analyse ICA.
• Développements d’outil d’analyse de graphe : comparaison de graphe, degrés, betweenness centrality, …
Outils : Matlab, Cshell, FSL, JMP, R, MySQL, SGE.