FLI
Vous trouverez dans cette rubrique les offres de stage, de thèses, de post doctorats, de CDD et CDI à pourvoir dans les laboratoires partenaires du réseau.
Liste des annonces
2018/06/04 – Contrat postdoctoral en biologie dans la cadre du projet Européen H2020 IDentIFY à Grenoble
Le projet Européen H2020 IDentIFY (Improving Diagnosis by Fast Field Cycling MRI) réunit 8 laboratoires et 2 industriels de 6 pays : France, Angleterre, Italie, Allemagne, Pologne et Finlande. C’est un projet de technologies pour la santé qui a pour buts (i) de construire une IRM à champ magnétique faible et variable, dit IRM à champ magnétique cyclique, (ii) d’apporter la preuve du concept de cette nouvelle technologie en médecine et (iii) de modéliser les signaux pour les associer à des paramètres biologiques dont les variations reflètent des processus physiopathologiques. Cette technologie donne des informations sur la dynamique moléculaire de l’eau dans le nano/microenvironnement du tissu exploré, une information invisible par les méthodes RMN/IRM conventionnelles à champ magnétique fixe et de valeur élevée.
A Grenoble nous disposons d'un champ magnétique cyclique (un des rares en France), installé à l’INAC (Institut des NAnosciences et Cryogénie) au CEA et notre activité est centrée sur l’étude des cancers agressifs comme celui du cerveau et du sein. Nous travaillons sur des lignées de cellules tumorales, des exérèses humaines, des tumeurs de modèles animaux ou encore sur des solutions/tissus synthétiques pour moduler une fonction physiologique
donnée, pour des études fondamentales. Le but in fine est de montrer dans quelle mesure les paramètres des signaux acquis en RMN à champ magnétique cyclique (signaux de relaxométrie) sont des biomarqueurs différentiant la région tumorale de la péritumorale et cette dernière de la région saine. La question clé est d’élucider les corrélât biologiques sous-jacents aux signaux physiques de relaxométrie.
Fonction : Mise en place et conduite des expériences biologiques fonctionnelles pour comprendre le rôle de la dynamique moléculaire de l’eau dans le processus du cancer et ses interactions avec les protéines.
Contrat: un an, voire 18 mois (selon date du début de la fonction), disponible dès à présent.
2018/03/22 – PhD fellowship: region-of-interest CT reconstruction for dose reduction, Lyon
The purpose of this PhD fellowship is to develop and analyze inversion algorithms for ROI reconstruction to obtain equivalent image quality compared to a full field-of-view CT. Both analytic and iterative reconstruction techniques will be investigated. There is currently no known analytic solution but the problem can be linked to the inversion of the one-dimensional (1D) truncated Hilbert transform which has a unique stable solution [3]. Instead, one can also do a conventional two-dimensional (2D) or three-dimensional (3D) iterative CT reconstruction [2].
The PhD fellow will approach both types of solutions for ROI CT reconstruction. First, he/she will investigate a numerical inversion of the truncated 1D Hilbert transform. Second, existing iterative reconstruction algorithms will be adpated to ROI CT. The investigations should determine under which circumstances equivalent image quality can be reached. The developments will use and enhance the Reconstruction Toolkit (RTK, http://www.openrtk.org/).
References:
[1] R. Clackdoyle and M. Defrise. Tomographic reconstruction in the 21st century. region-of-interest reconstruction from incomplete data. 27(4):60–80, 2010.
[2] R. Clackdoyle, F. Noo, F. Momey, L. Desbat, and S. Rit. Accurate transaxial region-of-interest reconstruction in helical CT? IEEE Transactions on Radiation and Plasma Medical Sciences, 1(4):334–345, July 2017.
[3] M. Defrise, F. Noo, R. Clackdoyle, and H. Kudo. Truncated Hilbert transform and image reconstruction from limited tomographic data. Inverse problems, 22(3):1037, 2006.
Period: three years starting in 2018.
More information : https://www.creatis.insa-lyon.fr/site7/sites/www.creatis.insa-lyon.fr/files/2018_phd_roidore_1.pdf
2018/03/22 – PhD fellowship: region-of-interest CT reconstruction for dose reduction, Lyon
The purpose of this PhD fellowship is to develop and analyze inversion algorithms for ROI reconstruction to obtain equivalent image quality compared to a full field-of-view CT. Both analytic and iterative reconstruction techniques will be investigated. There is currently no known analytic solution but the problem can be linked to the inversion of the one-dimensional (1D) truncated Hilbert transform which has a unique stable solution [3]. Instead, one can also do a conventional two-dimensional (2D) or three-dimensional (3D) iterative CT reconstruction [2].
The PhD fellow will approach both types of solutions for ROI CT reconstruction. First, he/she will investigate a numerical inversion of the truncated 1D Hilbert transform. Second, existing iterative reconstruction algorithms will be adpated to ROI CT. The investigations should determine under which circumstances equivalent image quality can be reached. The developments will use and enhance the Reconstruction Toolkit (RTK, http://www.openrtk.org/).
References:
[1] R. Clackdoyle and M. Defrise. Tomographic reconstruction in the 21st century. region-of-interest reconstruction from incomplete data. 27(4):60–80, 2010.
[2] R. Clackdoyle, F. Noo, F. Momey, L. Desbat, and S. Rit. Accurate transaxial region-of-interest reconstruction in helical CT? IEEE Transactions on Radiation and Plasma Medical Sciences, 1(4):334–345, July 2017.
[3] M. Defrise, F. Noo, R. Clackdoyle, and H. Kudo. Truncated Hilbert transform and image reconstruction from limited tomographic data. Inverse problems, 22(3):1037, 2006.
Period: three years starting in 2018.
More information : https://www.creatis.insa-lyon.fr/site7/sites/www.creatis.insa-lyon.fr/files/2018_phd_roidore_1.pdf
2018/03/20 – Post-doctoral position in multiparametric MRI of nonalcoholic steatohepatitis, LBI-CRI, Paris
Quantitative MRI offers promise in the diagnosis of inflammation and fibrosis in patients with nonalcoholic steatohepatitis (NASH), a frequent complication in type 2 diabetes. The Quid-NASH project in our laboratory aims to develop and validate multimodal non-invasive biomarkers of NASH which will result in a "virtual liver biopsy". Particularly, MR imaging will be used to provide physical quantification of mechanical properties, proton density fat fraction and derived metrics, magnetic susceptibility, water diffusivity, T2 and T1 relaxation times. Moreover, in small animal models of NASH, MRI will be combined with simultaneously acquired ultrafast ultrasound imaging in a hybrid approach. Radiomic analysis and heterogeneous data integration will be part of the project.
The successful candidate will play a key role in the clinical and preclinical studies of the Quid-NASH project. The candidate will be in charge of the development and optimization of the advanced image acquisition procedures. The candidate will ensure rigorous scientific conditions throughout the clinical trial and the small animal studies by interacting with the clinicians and scientists in the project.
The position has a 12-month initial employment basis and is renewable.
2018/03/20 – Post-doctoral position in multiparametric MRI of nonalcoholic steatohepatitis, LBI-CRI, Paris
Quantitative MRI offers promise in the diagnosis of inflammation and fibrosis in patients with nonalcoholic steatohepatitis (NASH), a frequent complication in type 2 diabetes. The Quid-NASH project in our laboratory aims to develop and validate multimodal non-invasive biomarkers of NASH which will result in a "virtual liver biopsy". Particularly, MR imaging will be used to provide physical quantification of mechanical properties, proton density fat fraction and derived metrics, magnetic susceptibility, water diffusivity, T2 and T1 relaxation times. Moreover, in small animal models of NASH, MRI will be combined with simultaneously acquired ultrafast ultrasound imaging in a hybrid approach. Radiomic analysis and heterogeneous data integration will be part of the project.
The successful candidate will play a key role in the clinical and preclinical studies of the Quid-NASH project. The candidate will be in charge of the development and optimization of the advanced image acquisition procedures. The candidate will ensure rigorous scientific conditions throughout the clinical trial and the small animal studies by interacting with the clinicians and scientists in the project.
The position has a 12-month initial employment basis and is renewable.
2018/03/20 – Post-doctoral position in radiomics of liver diseases, LBI – CRI, Paris
With high-throughput computing, it is now possible to extract innumerable quantitative features from MR images. Moreover, image data are increasingly interpreted in light of complementary data coming from other modalities, including genomics, transcriptomics and metabolomics. Thus, novel challenges in terms of data extraction, analysis and integration are emerging in the field. In response, novel methods such as machine learning or generalized statistical tools are gaining acceptance in the scientific and medical communities.
In this context, the proposed position involves the development, implementation and validation of novel post-processing methods of MR images to obtain imaging biomarkers of chronic liver diseases and liver tumors.
The position has a 12-month initial employment basis and is renewable.
2018/03/20 – Post-doctoral position in radiomics of liver diseases, LBI – CRI, Paris
With high-throughput computing, it is now possible to extract innumerable quantitative features from MR images. Moreover, image data are increasingly interpreted in light of complementary data coming from other modalities, including genomics, transcriptomics and metabolomics. Thus, novel challenges in terms of data extraction, analysis and integration are emerging in the field. In response, novel methods such as machine learning or generalized statistical tools are gaining acceptance in the scientific and medical communities.
In this context, the proposed position involves the development, implementation and validation of novel post-processing methods of MR images to obtain imaging biomarkers of chronic liver diseases and liver tumors.
The position has a 12-month initial employment basis and is renewable.
2018/03/07- CDD chef de projet coordination du nœud Paris centre et de la formation de France Life Imaging
Le réseau national France Life Imaging (FLI) recherche un(e) chef de projet pour assurer:
• L’animation et la coordination du nœud Paris Centre du réseau (40%)
• La coordination de la formation des personnels et des étudiants du réseau (40%)
• La communication nationale (20%)
Durée souhaitée : dès maintenant (CDD 6 mois)
Missions confiées:
• Pour la coordination du nœud Paris Centre,
o Animer le nœud : organiser les réunions du comité de pilotage et les événements
o Gestion des interactions entre les plates-formes et laboratoires de recherche du nœud,
o Rédiger le bilan scientifique et financier de la phase 1 du projet fin 2018 pour le nœud
o Centraliser :
Les relevés de dépenses tout en s’assurant que le budget est respecté, les comptes de résultat
Les coûts complets des différentes plateformes du nœud
• Pour la formation :
o Piloter les aides accordées pour la formation : lettre d’attribution, vérification de l’éligibilité des dépenses, recueil et vérification des justificatifs
o Soutien à la mise en place des formations en lien avec l’INSTN et les organismes de formation continue des tutelles de FLI
• Pour la communication, soutien à la cellule nationale.
Télécharger la fiche de poste
2018/03/07- CDD chef de projet coordination du nœud Paris centre et de la formation de France Life Imaging
Le réseau national France Life Imaging (FLI) recherche un(e) chef de projet pour assurer:
• L’animation et la coordination du nœud Paris Centre du réseau (40%)
• La coordination de la formation des personnels et des étudiants du réseau (40%)
• La communication nationale (20%)
Durée souhaitée : dès maintenant (CDD 6 mois)
Missions confiées:
• Pour la coordination du nœud Paris Centre,
o Animer le nœud : organiser les réunions du comité de pilotage et les événements
o Gestion des interactions entre les plates-formes et laboratoires de recherche du nœud,
o Rédiger le bilan scientifique et financier de la phase 1 du projet fin 2018 pour le nœud
o Centraliser :
Les relevés de dépenses tout en s’assurant que le budget est respecté, les comptes de résultat
Les coûts complets des différentes plateformes du nœud
• Pour la formation :
o Piloter les aides accordées pour la formation : lettre d’attribution, vérification de l’éligibilité des dépenses, recueil et vérification des justificatifs
o Soutien à la mise en place des formations en lien avec l’INSTN et les organismes de formation continue des tutelles de FLI
• Pour la communication, soutien à la cellule nationale.
Télécharger la fiche de poste
2018/03/07 – CDD gestion financière et administrative en soutien à la coordination de l’infrastructure France Life Imaging
FLI a mis en place un comité de pilotage et une cellule nationale pour la coordination opérationnelle. L’organisation générale de la cellule nationale FLI est la suivante : un responsable scientifique et technique, un(e) responsable opérationnel(le); un(e) responsable administratif(ve) et financier(e) qui fait l’objet de la fiche de poste actuelle à recruter par le CEA; un(e) responsable de la formation et un(e) chargé(e) de mission pour développer les collaborations et les partenariats des plateformes de FLI.
Objet du recrutement : Assister la chef de projet dans la gestion du projet FLI
Missions confiées
• Centraliser et vérifier :
- les relevés de dépenses tout en s’assurant que le budget est respecté
- les comptes de résultat
- les coûts complets
des différents partenaires du projet.
• Piloter le conventionnement (établissement d’avenants) avec les différents partenaires et contrôler les versements aux partenaires
• Suivi du budget de la part CEA du projet FLI
• Piloter les aides accordées pour les amorces de collaboration : lettre d’attribution, vérification de l’éligibilité des dépenses, recueil et vérification des justificatifs
Durée de la mission : 6 mois renouvelables